Kondrashov Group
Evolutionäre Genomik
Wie wurden lebende Organismen so, wie sie heute sind? Die Kondrashov Gruppe beschäftigt sich damit, die natürliche Welt in einem evolutionären Kontext zu verstehen. Aufgrund der Fülle von Daten über DNA- und Proteinsequenzen konzentriert sich die Gruppe typischerweise auf die Untersuchung genetischer Information.
Kondrashov und seine Gruppe beschränken sich nicht darauf, spezifische Funktionen oder Phänotypen zu untersuchen. Ein wesentliches Merkmal ihrer Forschung ist stattdessen der Fokus darauf, wie sich Funktionen und Phänotypen im Laufe der Zeit verändern. Daher ist ihre Arbeit inhärent interdisziplinär. Sie basiert auf klassischen evolutionären Gebieten, wie Populationsgenetik oder molekulare Evolution, aber stützt sich auch auf andere Felder, wie die Zell- und Molekularbiologie, Bioinformatik und Biophysik. In letzter Zeit interessiert sich die Gruppe zunehmend für den experimentellen Test von Fitness-Landschaften. Durch eine Kombination aus Experimenten, Theorie und Bioinformatik fragt die Gruppe, wie Veränderungen im Genotyp die Fitness oder spezifische Phänotypen beeinflussen. In naher Zukunft möchte die Gruppe ihre experimentellen Möglichkeiten erweitern, um eine größere Bandbreite an interessanten Phänotypen mittels Hochdurchsatz-Tests zu untersuchen.
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Laufende Projekte
Empirische Fitnesslandschaften | Proteinevolution im Kontext der Epistase | Populationsgenomik des Löffelstrandläufers
Publikationen
Wolfsberger W, Chhugani K, Shchubelka K, Frolova A, Salyha Y, Zlenko O, Arych M, Dziuba D, Parkhomenko A, Smolanka V, Gümüş ZH, Sezgin E, Diaz-Lameiro A, Toth VR, Maci M, Bortz E, Kondrashov F, Morton PM, Łabaj PP, Romero V, Hlávka J, Mangul S, Oleksyk TK. 2023. Scientists without borders: Lessons from Ukraine. GigaScience. 12. View
Gert KRB, Panser K, Surm J, Steinmetz BS, Schleiffer A, Jovine L, Moran Y, Kondrashov F, Pauli A. 2023. Divergent molecular signatures in fish Bouncer proteins define cross-fertilization boundaries. Nature Communications. 14, 3506. View
Pak MA, Markhieva KA, Novikova MS, Petrov DS, Vorobyev IS, Maksimova E, Kondrashov F, Ivankov DN. 2023. Using AlphaFold to predict the impact of single mutations on protein stability and function. PLoS ONE. 18(3), e0282689. View
Chhugani K, Frolova A, Salyha Y, Fiscutean A, Zlenko O, Reinsone S, Wolfsberger WW, Ivashchenko OV, Maci M, Dziuba D, Parkhomenko A, Bortz E, Kondrashov F, Łabaj PP, Romero V, Hlávka J, Oleksyk TK, Mangul S. 2022. Remote opportunities for scholars in Ukraine. Science. 378(6626), 1285–1286. View
Baumgartner M, Zirnbauer R, Schlager S, Mertens D, Gasche N, Sladek B, Herbold C, Bochkareva O, Emelianenko V, Vogelsang H, Lang M, Klotz A, Moik B, Makristathis A, Berry D, Dabsch S, Khare V, Gasche C. 2022. Atypical enteropathogenic E. coli are associated with disease activity in ulcerative colitis. Gut Microbes. 14(1), e2143218. View
ReX-Link: Fyodor Kondrashov
Karriere
seit 2017 Professor, Institute of Science and Technology Austria (ISTA)
seite 2012 Scientific Director of the School of Molecular and Theoretical Biology
2011 – 2017 ICREA Research Professor, Centre for Genomic Regulation, Barcelona, Spain
2008 – 2017 Junior Group Leader, Centre for Genomic Regulation, Barcelona, Spain
2008 PhD, University of California, San Diego, USA
Ausgewählte Auszeichnungen
2017 ERC Consolidator Grant
2016 Plan Estatal, Spanish Ministry of Economics and Competitiveness
2016 Zimin Foundation Grant for School of Molecular and Theoretical Biology
2014 ERC Starting Grant
2013 Plan Nacional Grant, Spanish Ministry of Economics and Competitiveness
2012 Howard Hughes Medical Institute International Early Career Scientist Award
2011 EMBO Young Investigator Award
2010 Theodosius Dobzhansky Prize from Society for the Study of Evolution
2010 Plan Nacional Grant, Spanish Ministry of Science and Innovation
2005 National Science Foundation Graduate Research Fellow
